Göz anjiyosu tehlikeli değil, aksine gözde damar tıkanıklıklarından lazer tedavisi gerektiren hastalıklara kadar geniş bir skalada sorunları tanımlamayı amaçlayan gerekli bir işlemdir. İşlemin yarım saat civarı sürdüğü belirtilmektedir. Gözlere zararı olmamasına karşın, işlemin bazı küçük yan etkileri bünyeden bünyeye farklı şekillerde görünebilir.Işığa aşırı duyarlılık, görmede bulanıklık en sık görülen yan etkilerdir.Mide bulantısı nadir görülen yan etkilerdendir ve çabuk geçer.Boya maddesi bazı hastalarda alerjik reaksiyonlara sebep olabilir.Boya maddesi yaklaşık bir hafta giderek azalmak kaydıyla idrar rengini koyultabilir.İlaç kol damarlarından verilmesi sebebiyle bazı hastalarda hafif ağrı ve şişlik gözlenmesi mümkündür.